En İyi 10 İlaç Keşif Yazılımı

İlaç keşif yazılımı pazarı üç kategoriye ayrılır: yapı temelli tasarım için hesaplamalı kimya paketleri, üretken kimya ve hedef tanımlama için yapay zeka tabanlı platformlar ve ELN, LIMS, sentez takibi, veri analizi ve bileşik kaydı için Ar-Ge veri yönetim sistemleri.

En iyi 10 ilaç keşif platformunu özellikler, fiyatlandırma ve dağıtım modelleri açısından karşılaştırdık.

En İyi 10 İlaç Keşif Yazılımı Dağıtım ve Fiyatlandırma Karşılaştırması

Not: Ürünler alfabetik olarak listelenmiştir. Ürünlerin hiçbirinin ücretsiz planı veya deneme sürümü yoktur.

İlaç Keşif Yazılımı Özellik Karşılaştırması

AIDDISON

AIDDISON, üretken yapay zekayı bilgisayar destekli ilaç tasarım araçlarıyla birleştiren bulut tabanlı bir ilaç keşif platformudur. Moleküler üretim, sanal tarama, ADMET tahmini, farmakofor ve benzerlik aramaları, moleküler yerleştirme ve retrosentez planlamasını destekler.

Başlıca yetenekleri şunlardır:

• Üretken moleküler tasarım: Yeni küçük moleküller oluşturur ve bunları ilaç benzerliği, ADMET özellikleri, bağlanma afinitesi ve sentezlenebilirlik için optimize eder.
• Kimyasal uzay araması: Benzerlik, alt yapı ve farmakofor yöntemlerini kullanarak 60 milyardan fazla bilinen ve sanal molekülü tarar.
• Moleküler yerleştirme: Protein-ligand etkileşimlerini görselleştirir, bağlanma ceplerini tanımlar ve aday bağlanmayı değerlendirir.
• Sentez planlaması: Sanal molekül tasarımını retrosentez ve ticari olarak temin edilebilir başlangıç malzemeleriyle birleştirir.
• Özel tahminler: Ekiplerin mevcut yapay zeka/ML modellerini kullanmasına veya kendi verileriyle model eğitmesine olanak tanır.

AIDDISON, molekül tasarımından sentez planlamasına kadar entegre, yapay zeka destekli bir iş akışı arayan medisinal kimya ekipleri için en uygunudur.

BIOVIA Discovery Studio

BIOVIA Discovery Studio, hedef tanımlamadan aday optimizasyonuna kadar uçtan uca bir iş hattı sunar. Araç, kurumsal veri yönetimi ve mevzuata uygunluk için Dassault Systèmes 3DEXPERIENCE platformuyla entegre olur.

BIOVIA Discovery Studio, hesaplamalı ilaç keşfinin ana bölümlerini kapsar:

• Simülasyonlar: Moleküler davranış ve etkileşimleri incelemek için moleküler dinamik, ücretsiz enerji hesaplamaları ve diğer simülasyon araçları.
• Yapı temelli tasarım: Protein-ligand yerleştirme, parça temelli tasarım ve 3D yapısal bilgileri kullanarak bileşikleri optimize etme araçları.
• Ligand ve farmakofor temelli tasarım: De novo ilaç tasarımı, aktivite profillemesi, çoklu hedef tasarımı ve istenen etkileşim desenlerine sahip molekülleri bulma yöntemleri.
• Biyoterapötikler ve antikor modelleme: Antikor modelleme, protein mühendisliği ve biyolojik optimizasyon için silico araçlar.
• Makromolekül tasarımı ve analizi: Proteinler, nükleik asitler ve diğer büyük biyolojik molekülleri analiz etme ve tasarlama araçları.
• QSAR, ADMET ve öngörücü toksikoloji: Farmakokinetik, güvenlik, toksisite ve ilaç benzeri özellikler için öngörücü içgörüler.
• Görselleştirme: Biyolojik ve kimyasal yapıları görüntülemek, işlemek ve analiz etmek için ücretsiz bir moleküler tasarım görselleştiricisi.

BIOVIA Discovery Studio, mevzuata uygunluk gerektiren büyük işletmeler için en uygunudur.

Şekil 1: BIOVIA Discovery Studio simülasyonlar panosu.¹

BioSolveIT

BioSolveIT, bir dizi görsel hesaplamalı ilaç keşif aracı sunar. Ürünleri arasında moleküler tasarım için SeeSAR, kimyasal uzay navigasyonu için infiniSee ve yüksek performanslı sanal tarama için HPSee bulunur.

Temel özellikleri şunlardır:

• Görsel ilaç tasarımı: SeeSAR moleküler yerleştirme, bileşik optimizasyonu, parça temelli tasarım ve protein-ligand etkileşim analizini destekler.
• Kimyasal uzay keşfi: infiniSee, yapısal veya farmakoforik olarak benzer moleküller için ultra geniş bileşik koleksiyonlarını tarar.
• Büyük ölçekli yerleştirme: Kimyasal Uzay Yerleştirme, yapı temelli tarama kullanarak milyarlarca bileşiği keşfeder.
• Yüksek performanslı iş akışları: HPSee, tarama ve yerleştirme iş yüklerini özel bilgi işlem altyapısına dağıtır.
• Özel modelleme araçları: Paket, yerleştirme, puanlama, moleküler hizalama, cep keşfi, konformer üretimi ve iskele atlama araçlarını içerir.

BioSolveIT, görsel iş akışlarına, moleküler yerleştirmeye ve geniş kimyasal uzay keşfine öncelik veren medisinal ve hesaplamalı kimyagerler için en uygunudur.

ChemAxon

ChemAxon, kimyasal veri standardizasyonu için Marvin kimyasal yapı editörü ve JChem motorları dahil olmak üzere kemoinformatik altyapısı sağlar. Platform, entegrasyon için Java ve REST API'leri ile bulut ve şirket içi dağıtımı destekler.

Chemaxon'un Marvin gerçek hayat örneği:

Büyük bir küresel ilaç şirketi, bir masaüstü veri görselleştirme ve analitik uygulaması içinde kimyasal veri yönetimini iyileştirmek için Chemaxon'un Marvin kimyasal editörünü kullandı.

Şirket, yaklaşan bir kullanıma alma tarihinden önce mevcut altyapısıyla sorunsuz entegre olabilecek bir kimyasal çizim aracına ihtiyaç duyuyordu. Gereksinimler arasında SMILES/SMARTS notasyonu, reaksiyon haritalama, stereokimya işleme, Markush yapı numaralandırması ve entegrasyon için güçlü bir .NET API desteği yer alıyordu.

Chemaxon, 300'den fazla kullanıcı için Marvin'i uyguladı ve daha küçük bir Marvin JS kullanıcı grubunu daha yeni Marvin ortamına yükseltti. Şirket, .NET API eklentisini şirketin mevcut sistemine entegre etti ve masaüstü analitik uygulamasıyla tam entegrasyon yaklaşık bir ila iki hafta içinde tamamlandı.

Proje, şirketin işlevsel, teknik veya iş gereksinimlerinden ödün vermeden lansman zaman çizelgesine uymasına yardımcı oldu. Ayrıca Chemaxon lisanslarını tek bir 19 aylık dönemde birleştirerek lisanslamayı basitleştirdi ve tedarik karmaşıklığını azalttı.²

Chemaxon, kimyasal veri standardizasyonu ve API entegrasyonu gerektiren kuruluşlar için en uygunudur.

Cresset Flare

Cresset Flare'ın XED kuvvet alanını kullanan elektrostatik alan tabanlı ligand modellemesi, protein kristal yapılarına bağımlı olmadan iskele atlaması ve ligand tasarımına olanak tanır. Flare, FEP çerçevesi içinde RBFE hesaplamalarını ve makrohalka konformer üretimini destekler.

• 2D Etkileşim Haritaları: Daha kolay yorumlama için ligand-protein etkileşimlerini net bir 2D görünümde özetler.
• Aktivite Atlası: Moleküler değişikliklerin aktiviteyi nasıl etkilediğini anlamaya yardımcı olacak nitel SAR içgörüleri sağlar.
• Aktivite Madencisi: SAR veri setlerinde aktivite ve seçicilik uçurumlarını tanımlar.
• FieldTemplater: Kristalografik protein yapı verileri mevcut olmadığında bağlanma modlarını tahmin etmeye yardımcı olur.
• Serbest Enerji Pertürbasyonu (FEP): Hangi ligand değişikliklerinin bağlanmayı iyileştirme olasılığının en yüksek olduğunu tahmin ederek aday optimizasyonunu destekler.
• Yapay zeka kodlama asistanı: Kullanıcıların Flare ile ilgili analiz iş akışları için kod yazmasına veya iyileştirmesine yardımcı olarak betik yazmayı, iş akışı otomasyonunu ve yöntem özelleştirmeyi destekler.

Cresset Flare, kristal yapıları olmadan çalışan medisinal kimyagerler için en uygunudur.

Şekil 2: Flare AI kodlama asistanı örneği.³

Dotmatics

Dotmatics, ELN, BioRegister, bileşik kaydı, deney veri yönetimi ile Studies ve Vortex görselleştirmesini kapsayan entegre bir bilimsel informatik platformu sunar. Platform, Geneious ve Prism dahil olmak üzere Dotmatics portföyü genelinde entegrasyon sağlar.

Dotmatics Luma, bilimsel verileri, iş akışlarını, analitiği ve yapay zeka araçlarını tek bir ortamda birleştiren yapay zeka tabanlı, çok modlu bir Ar-Ge platformudur. Araştırma ekiplerinin ham laboratuvar verilerinden kullanılabilir bilimsel içgörülere daha hızlı ulaşmasına yardımcı olmak için tasarlanmıştır. Luma dört ana adımda çalışır:

• Veri yakalama: Luma, laboratuvar cihazlarına, ELN'lere, kayıtlara, CRO yüklemelerine, dosyalara, bilimsel uygulamalara ve harici sistemlere bağlanır. Luma Lab Connect, dosya tabanlı cihazlardan, Windows veya Linux klasörlerinden, S3 bucket'lardan, API'lerden ve SQL/JSON/CSV kaynaklarından veri toplayabilir.
• Veri işleme: Veriler yakalandıktan sonra Luma ham dosyaları ayrıştırır, meta verileri çıkarır ve cihaz çıktılarını yapılandırılmış, analiz edilebilir formatlara dönüştürür.
• Veri uyumlaştırma ve yönetim: Luma, yapılandırılmış, yarı yapılandırılmış, yapılandırılmamış, dizi, sayısal, metin, görüntü ve meta veriler dahil olmak üzere farklı veri türlerini bir araya getirir.
• Analiz ve yapay zeka destekli içgörüler: Araştırmacılar, platform içinde veya API'ler aracılığıyla uyumlaştırılmış verileri arayabilir, görselleştirebilir, sorgulayabilir, modelleyebilir ve analiz edebilir. Luma ayrıca doğal dil sorgulamayı ve üretken yapay zeka kullanım durumlarını destekleyerek bilim insanlarının veri setleri arasındaki karmaşık ilişkileri keşfetmesine yardımcı olur.

Dotmatics, yönetişimli bir kayıt sistemi gerektiren büyük biyofarma şirketleri ve CRO'lar için en uygunudur.

OpenEye Scientific Suite Orion

Şimdi Cadence Molecular Sciences'ın bir parçası olan OpenEye Scientific, bulut tabanlı Orion platformu ve geliştirici odaklı OEChem araç seti ile farklılaşır. Paket, şekil tabanlı tarama için ROCS, elektrostatik karşılaştırma için EON, konformer üretimi için OMEGA ve yerleştirme için FRED'i içerir.

Orion, AWS ve Cadence OnCloud üzerinde çalışır, şirket içi kurulum seçeneği yoktur ve özel hesaplamalı iş hatları oluşturan kuruluşları hedefler.

OpenEye Scientific Suite Orion, özel iş hatları oluşturan geliştiriciler için en uygunudur.

Şekil 3: Orion'ın 3D simülasyon ve analiz panosu.⁴

Recursion OS

Recursion OS, hücresel fenotiplerin yüksek verimli otomatik görüntülenmesiyle oluşturulan, bilgisayarlı görü ve BioHive süper bilgi işlem altyapısı aracılığıyla işlenen devasa bir fenotipik veri setini mümkün kılar. Platform, biyolojik ilişkileri görselleştiren Biyoloji Haritası'nı içerir ve yaklaşık 65 petabaytlık özel mülk veri üretmiştir.

Recursion LOWE:

LOWE, Recursion'un LLM ile düzenlenmiş İş Akışı Motorudur; Recursion OS platformu içinde, doğal dil etkileşimi yoluyla karmaşık ilaç keşif iş akışlarını desteklemek üzere tasarlanmış yapay zeka destekli bir sistemdir.

Araştırmacıların Recursion'un biyolojik ve kimyasal veri setlerini sorgulamasını, potansiyel ilaç-hedef ilişkilerini keşfetmesini, yeni bileşikler üretip önceliklendirmesini, ADMET ve çözünürlük gibi özellikleri değerlendirmesini ve sentez planlaması ile deneysel uygulama dahil olmak üzere aşağı akış faaliyetlerini koordine etmesini sağlar.

LOWE, Recursion'un özel mülk veri setlerini, öngörücü modellerini, üretken kimya yeteneklerini ve laboratuvar operasyonlarını birbirine bağlayan akıllı bir iş akışı düzenleme katmanı olarak işlev görür.⁵

Recursion, nadir hastalık ve ilaç yeniden konumlandırma programları için en uygunudur.

Schrödinger küçük molekül ilaç keşif paketi

Schrödinger, bağlanma afinitesini tahmin eden fizik tabanlı Serbest Enerji Pertürbasyonu (FEP+) hesaplamalarıyla farklılaşır. Paket, Maestro grafik arayüzü içinde yerleştirme için Glide, hidrasyon termodinamiği için WaterMap ve protein yapı tahmini için Prime'ı entegre eder.

Schrödinger'in özel mülk programı gerçek hayat örneği:

Schrödinger'in dijital kimya platformu, 10 ay içinde yeni bir MALT1 inhibitörü olan SGR-1505'in geliştirme adayı olarak tanımlanmasına yardımcı oldu. Program, lenfosit düzenlemesinde rol oynayan ve kronik lenfositik lösemi dahil nükseden veya dirençli B-hücreli malignitelerle ilişkili bir hedef olan MALT1'e odaklandı. Daha önceki MALT1 inhibitörü yaklaşımları ilaç benzeri özelliklerle ilgili sorunlarla karşılaşmıştı, bu nedenle amaç, etki gücü, geçirgenlik, çözünürlük ve genel geliştirilebilirlik açısından daha iyi bir dengeye sahip güçlü bir küçük molekül bulmaktı.

Ekip, fizik tabanlı modelleme, makine öğrenimi, öngörücü ADMET modelleri ve veri analitiği ile desteklenen bir tasarla-tahmin et-üret-test et-analiz et iş akışı kullandı. 8 milyardan fazla bileşiği hesaplamalı olarak değerlendirdiler, bağlanma bölgesini analiz etmek için WaterMap'i kullandılar, fikir üretmek için de novo tasarım ve sentetik olarak farkında numaralandırma uyguladılar ve göreceli bağlanma afinitesini tahmin etmek için FEP+ kullandılar. LiveDesign, işbirlikçi karar verme için modellenmiş ve deneysel verileri merkezileştirmek amacıyla kullanıldı.

İlk üç ayda ekip, Aktif Öğrenme FEP+ kullanarak 1.700'den fazla molekülü değerlendirdi ve 50'den az bileşik sentezledikten sonra iki yeni güçlü MALT1 inhibitörü serisi tanımladı. Ardından, etki gücü, çözünürlük ve geçirgenliği dengelemek için çok parametreli optimizasyon kullandılar. Ekip 5.000'den fazla fikri değerlendirdi ve 43 bileşik program kriterlerini karşıladı ve daha küçük bir alt küme sentez ve teste alındı.

Sonuç, aday seride 78 bileşik ve tüm program boyunca 129 bileşik sentezlendikten sonra 10 ay içinde seçilen SGR-1505 oldu. Schrödinger, bu vakayı, büyük ölçekli hesaplamalı tarama, fizik tabanlı tahmin, makine öğrenimi ve işbirlikçi informatiği birleştirmenin sentezlenmesi gereken bileşik sayısını azaltırken hedef keşfinden geliştirme adayına giden yolu hızlandırabileceğinin kanıtı olarak sunmaktadır.⁶

Schrödinger, yüksek doğrulukta etki gücü modellemesi gerektiren farma ve biyoteknoloji ekipleri için en uygunudur.

Optibrium StarDrop

Optibrium StarDrop, aday optimizasyonu için çok parametreli optimizasyon (MPO) konusunda uzmanlaşmıştır. Platform, ADMET, üretken kimya ve 3D tasarım modülleri için modüler fiyatlandırma ile hem masaüstü hem de bulut dağıtımı sunar.

adMare ile StarDrop gerçek hayat örneği:

Kanadalı bir yaşam bilimleri şirketi olan adMare'nin çalışmaları, erken aday tanımlamadan klinik aday seçimine kadar uzanır ve kimyagerlerin bileşik etki gücünü, ADME özelliklerini, fizikokimyasal özellikleri, seçiciliği ve daha geniş yapı-aktivite ilişkilerini değerlendirmesini gerektirir. StarDrop, araştırmacıların karmaşık bileşik veri setlerini daha verimli bir şekilde düzenlemesine, görselleştirmesine ve yorumlamasına yardımcı olarak bu süreci destekler.

Dikkate değer bir uygulama patent analizidir. Kimyagerler patent literatüründen çok sayıda bileşik çıkardığında, StarDrop'un kümeleme, benzerlik analizi, kimyasal uzay görselleştirmesi ve Kart Görünümü özellikleri, ilgili başlangıç noktalarını belirlemeye ve bileşik serilerinin nasıl optimize edildiğini anlamaya yardımcı olur.

Ekip ayrıca StarDrop'u SAR eğilimlerini incelemek, pIC50 değerlerini karşılaştırmak, ADME QSAR kullanarak logP ve logD gibi özellikleri tahmin etmek, yerleştirme çalışmaları için bileşik kütüphaneleri hazırlamak ve sanal kütüphaneleri eSim3D ile taramak için kullanır.⁷

Optibrium StarDrop, ADMET ve aday optimizasyonuna öncelik veren medisinal kimyagerler için en uygunudur.

Kıyaslamalarımızı ve veri odaklı içgörülerimizi kaçırmayın. Düğme Google'ı açar; AIMultiple'ı seçmeniz, Google arama sonuçlarında AIMultiple'ı daha sık görmek istediğinizi onaylar.

Tercih edilen kaynak olarak ekle

Yapay Zeka Destekli İlaç Keşfi İçin Mevzuat ve Uyumluluk Hususları

Düzenleyici kurumlar, ilaç geliştirmede yapay zeka/ML için kılavuzlar oluşturmaya başlamıştır. Ocak 2025'te FDA, klinik olmayan, klinik ve üretim bağlamlarında kullanılan yapay zeka modelleri için riske dayalı bir güvenilirlik değerlendirme çerçevesi öneren “Yapay Zekanın Düzenleyici Karar Vermeyi Desteklemek İçin Kullanımına İlişkin Hususlar” hakkında taslak kılavuz yayınlamıştır.⁸ Kılavuz, düzenleyici kararları destekleyen verilere odaklanarak ilaç keşif faaliyetlerini açıkça kapsam dışında bırakmaktadır.⁹

Ocak 2026'da FDA ve EMA ortaklaşa olarak “İlaç Geliştirmede İyi Yapay Zeka Uygulamasının Yol Gösterici İlkeleri”ni yayınlayarak, ilaçların yaşam döngüsü boyunca insan merkezli tasarım ve orantılı doğrulama gerekliliklerini kapsayan on üst düzey ilke belirlemiştir.¹⁰ Kurumlar, yapay zeka sistemlerinin insan muhakemesinin yerini almaması, onu desteklemesi gerektiğini ve doğrulama gerekliliklerinin yapay zeka sisteminin potansiyel etkisine göre ölçeklendirilmesi gerektiğini vurgulamıştır.¹¹

Bu araştırmayı kaynak gösterin

Yayınlayacağınız yere uygun formatı seçin. Bağlantılı sürümü CMS'inize yapıştırmak, geri bağlantıyı korur.

@misc{ermut2026,
  author = {Ermut, Sıla},
  title  = {{En İyi 10 İlaç Keşif Yazılımı}},
  year   = {2026},
  month  = jul,
  howpublished    = {\url{https://aimultiple.com/drug-discovery-software}},
  note   = {AIMultiple. Erişim tarihi: 22 Temmuz 2026}
}

Referans Linkleri

1.

Molecular Dynamics Simulations | BIOVIA - Dassault Systèmes

3ds

2.

How a Global Pharma Leader Transformed Chemical Data Management with Marvin, Chemaxon’s chemical editor

Certara

3.

cresset-group.com | 520: Web server is returning an unknown error

4.

Cloud Based Computational Chemistry Software

5.

LOWE | Recursion

6.

Hit to development candidate in 10 months: Rapid discovery of a novel, potent MALT1 inhibitor - Schrödinger

Schrödinger

7.

Supporting Canadian chemistry pioneers with fast SAR analysis - Optibrium

Optibrium

8.

Federal Register :: Considerations for the Use of Artificial Intelligence To Support Regulatory Decision-Making for Drug and Biological Products; Draft Guidance for Industry; Availability; Comment Request

9.

FDA Publishes Draft Guidance on Use of Artificial Intelligence in the Development of Drugs and Biological Products - January 2025

10.

EMA and FDA set common principles for AI in medicine development | European Medicines Agency (EMA)

11.

Guiding Principles of Good AI Practice in Drug Development | FDA

Center for Drug Evaluation and Research

Sıla Ermut

Sektör Analisti

Takip Et

Sıla Ermut, AIMultiple'ta e-posta pazarlama ve satış videolarına odaklanan bir sektör analistidir. Daha önce proje yönetimi ve danışmanlık firmalarında işe alım uzmanı olarak çalıştı. Sıla, Sosyal Psikoloji alanında Yüksek Lisans ve Uluslararası İlişkiler alanında Lisans derecesine sahiptir.

Tam Profili Görüntüle

Yorum yapan ilk kişi olun

E-posta adresiniz yayınlanmayacak. Tüm alanlar gereklidir. Yorumlar orijinal dilinde bırakılır.

Ad

E-posta Adresi

Yorum

0/450

Yorumu Gönder